政府盖的门市房造成我们年年糟水灾!

前几年我们这里修省二级公路,路的两侧分为镇里和林场,我们一直是住在林场的(老一辈一直都在这里住),路修好以后,镇政府在林场这边买的地皮盖起了门市房.他们房子盖的非常高,门槛和我们窗台一样高,我们这里本来地势就洼,早些年房前屋后都有排水沟,下雨也都可以排水,自从盖了这批门市房以后三年,两个雨季都被水淹了,今年还有一个月就到雨季了,不想再被淹就找政府,政府说他们都换领导了,不太想管.(上一届领导给我们挖了大沟说要用石头垒起来,但是一直都不兑现).而且他们后来盖的房子是没有房产证的.我想问他们的房子属于违规房子吗?省二级公路两边多少米才可以盖房子?麻烦说的详细些.因为我们想上诉,告政府的话应该从什么地方先下手.听说不可以越级上告.谢谢帮助.